Curriculum
Curriculum Vitae
1. DATOS GENERALES:
NOMBRE: Luis Alfredo Cruz Ramírez
LUGAR DE NACIMIENTO Cd. Sahagún, Municipio de Tepeapulco, Hidalgo, México.
EDAD 43 años.
ESCOLARIDAD
Licenciatura: Ingeniero Agroindustrial.
- Instituto de Ciencias Agropecuarias de la Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo Diciembre de 1995.
Maestría en Ciencias en Bioquímica y Biología Molecular.
- Escuela Nacional de Ciencias Biológicas del Instituto Politécnico Nacional, Noviembre 2000.
1.1 Doctor en Ciencias en Bioquímica y Biología Molecular.
- Escuela Nacional de Ciencias Biológicas del Instituto Politécnico Nacional, Noviembre 2004.
1.2.1 Investigador Postdoctoral:
- “Caracterización molecular de los cambios en la arquitectura de la raíz en respuesta a la disponibilidad de fósforo en Arabidopsis thaliana”. Laboratorio Dr. Luis Herrera-Estrella. CINVESTAV-IPN Irapuato. 2005-2007 (2 años).
1.2.2 Postdoctoral Research Fellow:
- Utrecht University, The Netherlands. Laboratory of Molecular Genetics. Mayo 2007- Enero 2012 (4. 5 años). Research topics:
- “Unraveling the role of RBR in the diverse stem cells lineages of Arabidopsis”
- “RBR protein interactions in stem cell transitions”
2. PRODUCTOS DE INVESTIGACIÓN Y DESARROLLO
2.1.a ARTICULOS ORIGINALES DE INVESTIGACION.
2.1.a.1 Alfredo Cruz-Ramírez, Jose López-Bucio, Gabriel Ramírez-Pimentel, Andrés Zurita-Silva, Lenin Sánchez-Calderón, Enrique Ramírez-Chavez, Emmanuel Gonzalez-Ortega, and Luis Herrera-Estrella. The xipotl Mutant of Arabidopsis Reveals a Critical Role for Phospholipid Metabolism in Root System Development and Epidermal Cell Integrity. 2004, The Plant Cell, 16: 2020–2034. Rank 1 en Plant Sciences Top 10% **
2.1.a.2 Lenin Sánchez-Calderón, José López-Bucio, Alejandra Chacón-López, Alfredo Cruz-Ramírez, Fernanda Nieto-Jacobo, Joseph G. Dubrovsky and Luis Herrera-Estrella. Phosphate Starvation Induces a Determinate Developmental Program in the Roots of Arabidopsis thaliana. 2005, Plant Cell Physiol. Jan;46(1):174-84. Rank 10 en Plant Sciences Top 10% **
2.1.a.3 Alfredo Cruz-Ramírez, Araceli Oropeza-Aburto, Francisco Razo-Hernández, Enrique Ramírez-Chavez, Luis Herrera Estrella. Phospholipase DΖ2 plays an important role in extraplastidic galactolipid biosynthesis and Pi recycling in Arabidopsis roots. 2006, Proc. Nac. Acad. Sci. (PNAS) 103 : 6765–6770. (FFa6*). Rank 4 en Multidisciplinary Journals, Top 10%**
2.1.a.4 Alcaraz LD, Olmedo G, Bonilla G, Cerritos R, Hernández G, Cruz A, Ramírez E, Putonti C, Jiménez B, Martínez E, López V, Arvizu JL, Ayala F, Razo F, Caballero J, Siefert J, Eguiarte L, Vielle JP, Martínez O, Souza V, Herrera-Estrella A, Herrera-Estrella L. “The genome of Bacillus coahuilensis reveals adaptations essential for survival in the relic of an ancient marine environment”. 2008. Proc. Nac. Acad. Sci. (PNAS) Apr 15;105(15):5803-8). Rank 4 en Multidisciplinary Journals, Top 10%**
2.1.a.5 Claudia-Anahí Pérez-Torres, Jose López-Bucio, Alfredo Cruz-Ramírez, Enrique Ibarra-Laclette, Sunethra Dharmasiri, Mark Estelle and Luis Herrera-Estrella. Phosphate Availability Alters Lateral Root Development in Arabidopsis by Modulating Auxin Sensitivity via a Mechanism Involving the TIR1 Auxin Receptor. 2008, The Plant Cell, Vol. 20, 3258-3272. Rank 1 en Plant Sciences, Top 10% **
2.1.a.6 Araceli Oropeza-Aburto, Alfredo Cruz-Ramírez, Gustavo J. Acevedo-Hernández, Claudia-Anahí Pérez-Torres, Juan Caballero-Pérez, and Luis Herrera-Estrella. Functional analysis of the Arabidopsis PLDZ2 promoter reveals an evolutionarily conserved low-Pi-responsive transcriptional enhancer element. J Exp Bot. 2012 Mar;63(5):2189-202. doi: 10.1093/jxb/err446. Epub 2011 Dec 30. Rank 8 en Plant Sciences Top 10% **
2.1.a.7 Alatorre-Cobos, Alfredo Cruz-Ramírez, Celine A. Hayden, Claudia-Anahí Pérez-Torres, Anne-Laure Chauvin, Enrique Ibarra-Laclette, Erika Alva-Cortés, Richard A. Jorgensen and Luis Herrera-Estrella. Translational regulation of Arabidopsis XIPOTL1 is modulated by phosphocholine levels via the phylogenetically conserved upstream open reading frame 30. 2012 J. Exp. Bot. 63(14): 5203-5221. Rank 8 en Plant Sciences Top 10% **
2.1.a.8 Alfredo Cruz-Ramírez, Sara Díaz-Triviño, Ikram Blilou, Verónica A. Grieneisen, Athanasius F. M. Marée, Rosangela Sozzani, Christos Zamioudis, Pál Miskolczi, Jeroen Nieuwland, René Benjamins, Pankaj Dhonukshe, Juan Caballero-Pérez, Beatrix Horvath, Ari Pekka Mähonën, Jian Xu, James A.H. Murray, Philip N. Benfey, Laszlo Bako and Ben Scheres. (2011) An attenuated bi-stable circuit involving SCARECROW-RETINOBLASTOMA interaction mediates asymmetric stem cell divisions in Arabidopsis. 2012. Cell, Volume 150, 1002-15. *). Revista de investigación Rank 1 en Cell Biology Journals, Top 10%**
2.1.a.9 Marco Antonio Leyva-González, Enrique Ibarra-Laclette, Alfredo Cruz-Ramírez and Luis Herrera-Estrella. Functional and Transcriptome Analysis Reveals an Aclimatization Strategy for Abiotic Stress Tolerance mediated by Arabidopsis NF-YA Family members. 2012. PLoS One. 2012;7(10):e48138. doi: 10.1371/journal.pone.0048138. Epub 2012 Oct 31. Rank 9 en Multidiscliplinary Sciences Top 10%**
2.1.a.10 Serena Perilli, José Manuel Perez-Perez, Riccardo Di Mambro, Cristina Llavata Peris, Sara Díaz-Triviño, Marta Del Bianco, Emanuela Pierdonati, Laila Moubayidin, Alfredo Cruz-Ramírez, Paolo Costantino, Ben Scheres, and Sabrina Sabatini. RETINOBLASTOMA-RELATED Protein Stimulates Cell Differentiation in the Arabidopsis Root Meristem by Interacting with Cytokinin Signaling. November 2013. The Plant Cell vol. 25 no. 11 4469-4478. Rank 1 en Plant Sciences Top 10% **
2.1.a.11 Alfredo Cruz-Ramírez, Sara Díaz-Triviño, Guy Wachsman, Yujuan Du, Mario Arteága-Vázquez, Hongtao Zhang, Rene Benjamins, Ikram Blilou, Anne B. Neef, Vicki Chandler and Ben Scheres. A SCARECROW-RETINOBLASTOMA Protein Network Controls Protective Quiescence in the Arabidopsis Root Stem Cell Organizer. 2013. Plos Biology, 11: e1001724. Rank 1 de 85 Biology Journals, Top 10%**
2.1.a.12 Juliana L. Matos, Charles Hachez, On Su Lau, Alfredo Cruz-Ramírez, Ben Scheres, Dominique C. Bergman. Irreversible fate commitment in the Arabidopsis stomatal lineage requires a FAMA and RETINOBLASTOMA-RELATED module. 2014. eLife 03271. Rank 3 de 85 Biology Journals, Top 10%**
2.1.a.13 Yuchen Long, Wouter Smet, Alfredo Cruz-Ramírez, Bas Castelijns, Wim de Jonge, Ari Pekka Mähönen, Benjamin P. Bouchet, Gabino Sanchez Perez, Anna Akhmanova, Ben Scheres, and Ikram Blilou. Arabidopsis BIRD Zinc Finger Proteins Jointly Stabilize Tissue Boundaries by Confining the Cell Fate Regulator SHORT-ROOT and Contributing to Fate Specification. 2015. The Plant Cell tpc.114.132407. Rank 1 en Plant Sciences Top 10% **
2.1.a.14 Julieta Mireles-Ordaz, Abraham Arellano-Perusquia, Annie Espinal-Centeno, Lino Sánchez-Segura, Andrés Estrada-Luna y Luis Alfredo Cruz-Ramírez*. Reprogramación celular de embriones de Anthurium andraeanum por fitohormonas para micropropagación masiva. 2015. Nova Scientia Vol. 7, núm. 15: 49-67.
2.1.a.15 Lenin Yong-Villalobos, Sandra Isabel González-Morales, Kazimierz Wrobel, Dolores Gutiérrez-Alanis, Sergio Alan Cervantes-Peréz, Corina Hayano-Kanashiro, Araceli Oropeza-Aburto, Alfredo Cruz-Ramírez, Octavio Martínez, and Luis Herrera-Estrella. Methylome analysis reveals an important role for epigenetic changes in the regulation of the Arabidopsis response to phosphate starvation. 2015. PNAS 112 (52) E7293-E7302; published ahead of print December 14, 2015, doi:10.1073/pnas.1522301112. *). Rank 4 en Multidisciplinary Journals, Top 10%**
2016
2.1.a.16 Araceli Oropeza-Aburto, Alfredo Cruz-Ramírez A, Javier Mora-Macías, Luis Herrera-Estrella. A phosphate starvation-driven bidirectional promoter as a potential tool for crop improvement and in vitro plant biotechnology. Plant Biotechnol J. 2016 Oct 24.doi: 10.1111/pbi.12653. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 27775858. Plant Sciences Top 10%**
2.1.a.17 Alejandro Morales-Tapia and Alfredo Cruz Ramirez A*. Computational Modeling of Auxin: A Foundation for Plant Engineering. 2016 Front. Plant Sci. (7) 1881. doi: 10.3389/fpls.2016.01881 Plant Sciences Top 10%**
*Corresponding author
**16 Artículos cuyo valor debería ser duplicado, de acuerdo con el Apendice 3, 2.1.a, por estar publicados en Revistas dentro del 10% superior de la lista de revistas de la especialidad según el rank de SJR y excluyendo aquellas que publican sólo artículos de revisión.
2.1.g. RESUMENES DE PARTICIPACIONES EN CONGRESOS NACIONALES E INTERNACIONALES
2.1.g.1 XV Congreso Latinoamericano de Microbiología. XXXI Congreso Nacional de Microbiología. Merida, Yucatan Abril 13, 2000.
2.1.g.2 XXXII Congreso Nacional de Microbiología. Guanajuato, Gto. 3 al 5 de abril 2001. Cruz Ramírez, A. y Espinosa Lara A. Caracterización del plásmido pBacR2 de Staphylococcus aureus e identificación de la región que codifica para una bacteriocina. Poster
2.1.g.3 XXIV CONGRESO NACIONAL DE LA SOCIEDAD MEXICANA DE BIOQUIMICA. Puerto Vallarta, Jal. 3 al 8 de Noviembre 2002. Sánchez-Calderón, L., Hernández-Abreu, E., Cruz Ramírez, A., Chacón-López A., López-Bucio, J., Dubrovsky, J. y Luis Herrera-Estrella. Low Phosphate induces a genetically controlled program of determinate root development in Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. Poster
2.1.g.4 XXIV CONGRESO NACIONAL DE LA SOCIEDAD MEXICANA DE BIOQUIMICA. Puerto Vallarta, Jal. 3 al 8 de Noviembre 2002. Cruz Ramírez, L., López bucio, J., Sánchez Calderón, L., Ramírez Pimentel, G. y Herrera Estrella, L. MAPEO Y CARACTERIZACIÓN DE GENES INVOLUCRADOS EN EL ESTABLECIMIENTO DE LA ARQUITECTURA DEL SISTEMA RADICULAR DE Arabidopsis thaliana.
2.1.g.5 XI Congreso Nacional de Bioquímica y Biología Molecular de Plantas-5to Simposium México-EUA. Acapulco, Guerrero 3 al 7 de Noviembre 2003.
Alfredo Cruz-Ramírez, José López Bucio, Lenin Sánchez-Calderón, Gabriel Ramírez-PimentelD, Andrés Zurita-SilvaD, Emmanuel González-OrtegaM and Luis Herrera-Estrella. Effect of phosphocholine biosynthesis inhibition on Arabidopsis thaliana root development. Sesión plenaria.
2.1.g.6 XI Congreso Nacional de Bioquímica y Biología Molecular de Plantas-5to Simposium México-EUA. Acapulco, Guerrero 3 al 7 de Noviembre 2003.J. López Bucio, Fernanda Nieto-Jacobo, Alfredo Cruz, E. Hernández-Abreu, A. Zurita, V. Limones, N. Marsch, L. Sánchez-CalderónD, M. Dubrovsky, J. and Herrera-Estrella, L. Physiology and Molecular Genetics of the Arabidopsis response to phospate availability. Sesión plenaria.
2.1.g.7 XI Congreso Nacional de Bioquímica y Biología Molecular de Plantas-5to Simposium México-EUA. Acapulco, Guerrero 3 al 7 de Noviembre 2003.Sánchez Calderón, L., Cruz Ramírez, L., López Bucio, J., Dubrovsky, J. y Herrera Estrella, L. Low Phosphate induces a genetically controled program of determinate root development in Arabidopsis thaliana (L) Heynh. Poster
2.1.g.8 XI Congreso Nacional de Bioquímica y Biología Molecular de Plantas-5to Simposium México-EUA. Acapulco, Guerrero 3 al 7 de Noviembre 2003.González-Ortega, E., Cruz-Ramírez, A., López-Bucio, J., Herrera-Estrella, L. Characterizarion of an Arabidopsis thaliana mutant with altered post-embryonic root development and reduced cell division in the primary and lateral root meristems. Poster
2.1.g.9 XV Congreso Nacional de Investigación y Desarrollo Tecnológico. 1 al 3 de Diciembre, 2004. Campeche.Ramírez-Pimentel Juan Gabriel, Cruz-Ramírez Alfredo, Vielle-Calzada Jean Philippe, Herrera-Estrella, Luis. “Caracterización de ced-1 una mutante de Arabidopsis thaliana afectada en elongación celular” Ponencia.
2.1.g.10 Workshop on Plant stem cells: Independent inventions and conserved mechanisms. Instituto Juan March de Estudios e Investigaciones. 23-25 Mayo 2005. Madrid, Spain.
Alfredo Cruz-Ramírez, Araceli Oropeza-Aburto, Enrique Ramírez-Chávez, Francisco Razo-Hernández and Luis Herrera-Estrella. “The role of PLDZ2 in root mersitem maintenance under low P availability conditions”. Poster
2.1.g.11 VII Congreso Nacional de la Sociedad Mexicana de Biología del desarrollo. Nov 11- 2005. Taxco, Guerrero. Alfredo Cruz-Ramírez, Araceli Oropeza-Aburto, Francisco Razo-Hernández, Enrique Ramírez-Chávez, Alejandra Chacón-López, Luis Herrera-Estrella. “El papel del metabolismo de fosfolípidos en el desarrollo del sistema radicular de Arabidopsis thaliana”. Platica
2.1.g.12 The 2nd Panamerican Plant Membrane Biology Workshop. South Padre Island, Texas, USA. 17-20 May, 2006. Cruz-Ramírez, A., Calderón-Vázquez, C., Oropeza-Aburto, A., Razo-Hernández, F., Chacón-López A., Sánchez-Calderón, L., Ramírez-Chávez, E., and Herrera-Estrella, L. “Characterization of the general response of Arabidopsis thaliana to phosphate starvation and the effects on cell membrane composition”. Platica
2.1.g.13 XXVI Congreso nacional Sociedad Mexicana de Bioquímica. Guanajuato, Gto. 12 al 17 de Noviembre 2006. Análisis de la expresión de la Udp-Glucosa Epimerasa 5 de Arabidopsis thaliana y su papel en la síntesis de galactolípidos en condiciones de carencia de fósforo. Zumaya González J., Aguado Cruz, G., Cruz Ramíez A., Chavez Ramírez, E. y Herrera Estrella, L. Poster
2.1.g.14 XXVI Congreso nacional Sociedad Mexicana de bioquímica. Guanajuato, Gto. 12 al 17 de Noviembre 2006. Caracterización de la mutante CCA1 en respuesta al estrés por fósforo. Ochoa Montes, J.,Chacón López, A., Cruz Ramíez A., y Herrera Estrella, L . Poster
2.1.g.15 XXVI Congreso nacional Sociedad Mexicana de bioquímica. Guanajuato, Gto. 12 al 17 de Noviembre 2006. Alegría Mundo, H., Cruz Ramíez A., Herrera Estrella, L. y Cruz Hernández A. Poster
2.1.g.16 Joint Annual Meeting American Society of plant Biologists and Sociedad Mexicana de Bioquímica-Bioquímica y Biología Molecular de Plantas. Merida, México Junio 26-Julio 1, 2008. Alatorre-Cobos, Alva-Cortes, Cruz-Ramírez, Hayden, Jorgensen and Herrera Estrella. Tissue-specific postranscriptional regulation of XIPOTL1 (PEAMT). Poster
2.1.g.17 19th International Conference on Arabidopsis Research. Montreal, Canada. July 23-27, 2008. Alatorre-Cobos, Alva-Cortes, Cruz-Ramírez, Hayden, Jorgensen and Herrera Estrella. Tissue-specific postranscriptional regulation of XIPOTL1 (PEAMT). Poster
2.1.g.18 19th International Conference on Arabidopsis Research. Montreal, Canada. July 23-27, 2008. Anahí Pérez-Torres, José López-Bucio, Alfredo Cruz-Ramírez, Enrique Ibarra-Laclette, Mark Estelle and Luis Herrera-Estrella. An auxin sensitivity mechanism is involved in Lateral Root Development under phosphate deprivation conditions. Poster
2.1.g.19 21st International Conference on Arabidopsis Research ICAR Yokohama, Japan. June 6 -10, 2010. “The RETINOBLASTOMA RELATED PROTEIN (RBR) regulates asymmetric cell division in the Arabidopsis thaliana Root” Alfredo Cruz-Ramírez, et.al. Poster
2.1.g.20 22nd International Conference on Arabidopsis Research ICAR University of Wisconsin, Madison. USA. June 22 -25, 2011. Sara díaz-Trivino, Alfredo Cruz-Ramírez, Yujuan Du, Ikram Blilou, Hongtao Zhang, Yuchen Long and Ben Scheres. amigo RBR is a useful tool for network disection. Poster
2.1.g.21 Plant Growth Biology and Modeling September 19-21, 2011, in Elche (Spain). Poster
2.1.g.22 1er Simposium Internacional de Epigenética y Biología del desarrollo. Xalapa Veracruz, Noviembre 2012. Silencing a represor in a cell-type manner. Alfredo Cruz-Ramírez. Platica Plenaria.
2.1.g.23 Cantoblanco Workshops on biology. Chromatin at the nexus of cell division and differentiation. 2008. Madrid Spain. Poster Cruz-Ramírez Alfredo, Kornet Noor, Díaz-Trivino Sara and Scheres Ben. “UNRAVELING THE ROLE OF POLYCOMB GENES AND RETINOBLASTOMA IN ROOT STEM CELL MAINTEINANCE”. Poster. (sin copia de abstract)
2.1.g.24 National Meeting of the Netherlands Institute of Regenerative Medicine (NIRM). June 21st, 2010. Utrecht, The Netherlands. Cruz Ramírez-Alfredo “Progression of differentiation in an Arabidopsis stem cell lineage involves interactions between Retinoblastoma proteins and stem cell regulators” (sin copia de abstract).
2.1.g.25 Experimental Plant Sciences Meeting. Lunteren, the Netherlands. April, 2010. “RETINOBLASTOMA RELATED PROTEIN (RBR) regulates asymmetric cell division in the Arabidopsis thaliana Root” Platica (sin copia de abstract)
2.1.g.26 Annual Experimental Plant Sciences Meeting: Developmental Biology of Plants. January 20, 2011. Leiden University, the Netherlands. Progression of differentiation in an Arabidopsis stem cell lineage involves interactions between RBR and stem cell regulators. Platica (sin copia de abstract).
2.1.g.27 Identification and study of the miR-125 family in Ambystoma mexicanum limb regeneration. Adan Giovani Gómez-Landin1, Luis Fernando García-Ortega1, Mario Arteaga-Vázquez2, Xuemei Chen3, Luis HerreraEstrella1, Alfredo Cruz-Ramírez. Society for Developmental Biology 74th Annual Meeting.Snowbird, Utah, July 9-13, 2015. (poster)
2.1.g.28 Analysis of the Cyclin D1/Cyclin Dependent Kinase 4 complex during limb regeneration of Ambystoma mexicanum. Miguel Angel Garcia-Olivares, Luis Herrera-Estrella, Luis Fernando García Ortega and Alfredo Cruz-Ramírez. Society for Developmental Biology 74th Annual Meeting.Snowbird, Utah, July 9-13, 2015.
2.1.g.29 Morpho-physiological and molecular characterization of the response to low phosphorus in Marchantia polymorpha L. FE Rico-Resendiz, A Oropeza-Aburto, MA Arteaga-Vazquez, LA Cruz-Ramirez and LR Herrera-Estrella. XVI National Congress of Biochemistry and Plant Molecular Biology9th Symposium Mexico – USA, Querétaro México 2015.
2.1.g.30 Modelling Auxin dynamics during early Arabidopsis thaliana embryogenesis. Jose Alejandro Morales Tapia, Luis Alfredo Cruz Ramirez. XVI National Congress of Biochemistry and Plant Molecular Biology9th Symposium Mexico – USA, Querétaro México 2015.
2016
2.1.g.31 Transcriptómica de la metamorphosis de Ambystoma velasci. Janet Palacios-Martínez, Juan Caballero Pérez, Arturo Vergara Iglesias and Alfredo Cruz-Ramírez. XII Congreso Nacional de la Sociedad Mexicana de Biología del Desarrollo. Lagos de Moreno, Jalisco. 8-12 de Marzo del 2016.
2.1.g.32 Identificación de la familia de proteínas Pocket y su análisis durante el proceso de regeneración de extremidad en Ambystoma mexicanum. Annie Espinal-Centeno, Laszlo Bako y Alfredo Cruz-Ramírez. XII Congreso Nacional de la Sociedad Mexicana de Biología del Desarrollo. Lagos de Moreno, Jalisco. 8-12 de Marzo del 2016.
2.1.g.33 Estudio de la capacidad regenerative dependiente del estado de desarrollo de Ambystoma mexicanum y Ambystoma velasci.Tania Janeth Quintana-Gómez, Annie Espinal-Centeno y Alfredo Cruz-Ramírez. XII Congreso Nacional de la Sociedad Mexicana de Biología del Desarrollo. Lagos de Moreno, Jalisco. 8-12 de Marzo del 2016.
2.1.g.34 Multitissue Transcriptomics of Ambystoma Mexicanum. Juan Caballero, Annie Espinal-Centeno, Luis García-Ortega, Francisco Falcón-Chavez, Mario Arteaga-Vazquez, Andrés Cruz-Hernández, Laszlo Bako, Luis Herrera-Estrella and Alfredo Cruz-Ramirez.EMBO Workshop: Molecular mechanisms of ageing and regeneration: From pluripotency to senescence. 16-24 Agosto 2016, Spetses Grecia.
2.1.g.35 Transcriptomic Lanscape of the Axolotl. Alfredo Cruz-Ramirez, Juan Caballero, Annie Espinal-Centeno, Luis García-Ortega, Francisco Falcón-Chavez, Mario Arteaga-Vazquez, Andrés Cruz-Hernández, Laszlo Bako, Luis Herrera-Estrella. EMBO conference: The Molecular and Cellular basis of regeneration and tissue repair, Paestum, Italia. 17-21 de Septiembre 2016.
2.2 Artículos de revisión en libros publicados por una casa editorial reconocida o revistas de circulación internacional.
2.2.1 José López-Bucio, Alfredo Cruz-Ramírez and Luis Herrera-Estrella The role of nutrient availability in regulating root architecture. 2003, Current Opinion in Plant Biology, 6:280–287 (Review).
2.2.2 María Cruz-Santos, Alejandro Aragón-Raygoza, Annie Espinal-Centeno A, Mario Arteaga-Vázquez M, Andrés Cruz-Hernández, Laszlo Bako and Alfredo Cruz-Ramírez*. The Role of microRNAs in Animal Cell Reprogramming. Stem Cells Dev. 2016 Jul 15;25 (14):1035-49.(Concise Review).
2.3 Capítulos de investigación original en extenso en libros especializados, publicados por una casa editorial reconocida.
2.3.1 J. López-Bucio, A. Cruz-Ramírez, A. Pérez-Torres, J. G. Ramírez-Pimentel, L. Sánchez- Calderón and L. Herrera-Estrella. Root architecture. In Plant Architecture and its Manipulation, Edited by Collin Turnbull, Annual Plant Reviews, Volume 17, 2005. Ed. Blackwell Publishing.
2.3.2 Cruz-Ramírez Luís Alfredo, Valdez-Morales Maribel, Chacón-López Martina Alejandra, Rosas-Cárdenas Flor de Fátima and Cruz-Hernández Andrés. Mexican crops of agroalimentary importance. In Advances in Agricultural and Food Biotechnology. Edited by Ramón Gerardo Guevara-González and Irineo Torres-Pacheco. Research Signpost 2006: 35-53 ISBN: 81-7736-269-0.
2.3.3 Cruz-Ramírez A, Calderón-Vázquez and Herrera-Estrella L. Effect of Nutrient Availability on Root System Development. pp 288–324. in Annual Plant Reviews Volume 37: Root Development. 2009, Edited by Tom Beeckman. Wiley-Blackwell Publishing.
2.3.4 Cruz-Ramírez Luis Alfredo, García-Ramírez Jesús Agustín, Rico-Resendiz Felix Edgardo, Membrilla-Ochoa Alfonso, Herrada-Alonso Janette, Escobar-Feregrino Tania, Torres-Pacheco Irineo, Guevara-González G. Ramón,Campos-Guillén Juan and Cruz-Hernández Andrés. Plants as Bioreactors for Human Health Nutrients. Chapter 15 in Biosystems Engineering: Biofactories for Food Production in the Century XXI. 2013. Springer International Publishing, 423-54.
2.3.5 Christopher A. Cedillo-Jiménez, Marcelo Hernández–Salazar, Tania Escobar-Feregrino, Juan Caballero-Pérez, Mario Arteaga-Vázquez, Alfredo Cruz-Ramírez, Irineo Torres-Pacheco, Ramón Guevara-González, Andrés Cruz-Hernández. MicroRNAs Sequencing for Understanding the Genetic Regulation of Plant Genomes. 2015. In «Plant Genomics», ISBN 978-953-51-4622-3 INTECH Ed. (Accepted and in press).
2.12 DIFUSIÓN CIENTÍFICA
2.12.1 Akie Shimotohno, Hongtao Zhang, Alfredo Cruz-Ramírez and Scheres Ben. How to stimulate stem cells in plants (2011). Netherlands Proteomics Center Highlights. Volume 14-11-11.
3.0 FORMACIÓN DE RECURSOS HUMANOS.
3.0.1 Formación de estudiante de Maestría Miguel Angel García Olivares del programa de Biotecnología de Plantas, CINVESTAV IRAPUATO. (Titulado)
3.0.2 Formación de estudiante de Maestría Jesús Alejandro Aragón Raygoza del programa de Biología Integrativa UGA, CINVESTAV IRAPUATO. (Titulado)
3.0.3 Formación de estudiante de Maestría Adán Gómez Landín del programa de Biotecnología de Plantas, CINVESTAV IRAPUATO. (Titulado)
3.0.4 Formación de estudiante de Maestría José Alejandro Morales del programa de Biología Integrativa UGA, CINVESTAV IRAPUATO. (Titulado)
3.0.5 Formación de estudiante de Maestría Félix Edgardo Rico Reséndiz del programa de Biotecnología de Plantas, CINVESTAV IRAPUATO. (Titulado, Co-dirección)
3.0.6 Formación de estudiante de Doctorado Janet Palacios Martínez del programa de Biología de Plantas, CINVESTAV IRAPUATO. (En proceso)
3.0.7 Formación de estudiante de Doctorado Hugo Varela Rodríguez del programa de Biotecnología de Plantas, CINVESTAV IRAPUATO. (En proceso)
3.0.8 Formación de estudiante de Doctorado Jesús Alejandro Aragón Raygoza del programa de Biología Integrativa UGA, CINVESTAV IRAPUATO. (En proceso)
3.0.9 Formación de estudiante de Maestría Melissa Dipp Álvarez del programa de Biotecnología de Plantas, CINVESTAV IRAPUATO. (En proceso)
3.0.10 Formación de estudiante de Francisco Javier Falcón Chávez del programa de Biología Integrativa UGA, CINVESTAV IRAPUATO (En proceso)
3.0.11 Formación de estudiante de Doctorado Félix Edgardo Rico Reséndiz del programa de Biotecnología de Plantas, CINVESTAV IRAPUATO. (En proceso, Co-dirección)
3.1 CURSOS TEORICO Y/O PRACTICOS.
3.1.a.1 Profesor de posgrado de Biología Integrativa en curso de Biología Celular y del Desarrollo 2013 a la fecha. UGA-CINVESTAV IRAPUATO y Coordinador del curso desde 2015.
3.1.a.2 Profesor de posgrado de Biotecniología de Plantas en curso de Biología Molecular 2015. CINVESTAV IRAPUATO.
3.1.b. En otros programas externos de nivel superior
3.1.b.1 Profesor de asignatura A. 10 horas/s/m Febrero-Julio 2001 (25 semanas). Genética Microbiana, Licenciatura en Q.B.P. Escuela Nacional de Ciencias Biológicas del I.P.N.
3.1.b.2 Clase en curso de posgrado, curso: La ingeniería Genética y sus aplicaciones. Escuela Nacional de Ciencias Biológicas del I.P.N. Marzo, 2004.
3.1.b.3 Clase en el Programa de Maestría en ciencia y tecnología de Alimentos. Universidad Autónoma de Querétaro. Octubre 18 2005. 2 horas.
3.1.b.4 Clase en el Programa de Doctorado en Ciencias de los Alimentos. Universidad Autónoma de Querétaro. Octubre 31, 2005. 2 horas
3.1.b.5 Profesor de posgrado de Biología Integrativa en curso de Biología Celular y del Desarrollo 2014.
3.3 DIRECCIÓN DE OTRAS TESIS
3.3.1 Du Yu Juan (Cum laude). Utrecht University. The Netherlands. Co-director. Tesis de Maestría, Titulada.
3.3.2 Francisco Razo Hernández. Universidad de Guanajuato. México. Tesis de Licenciatura. Titulado.
3.3.3 Lenin Federico Yong Sánchez. Instituto Tecnológico Superior de Celaya. México. Tesis de Licenciatura. Titulado.
3.3.4 Horacio Alegría Mundo. Instituto Tecnológico Superior de Celaya. México. Tesis de Licenciatura. Titulado.
3.3.5 Omar Ordaz Orozco. Instituto Tecnológico Superior de Irapuato. México. Tesis de Licenciatura. Titulado.
3.3.6 Tania Janeth Quintana Gómez. Instituto Tecnológico Superior de Irapuato. México. Tesis de Licenciatura. Titulado.
3.3.7 Juan Carlos Mireles Navarro. Universidad Politécnica de Penjamo. Tesis de Licenciatura. En proceso.
3.3.8 Ericka Berenice Sánchez García. Universidad Politécnica de Penjamo. Tesis de Licenciatura. En Proceso
3.3.9 Caudia Cecilia Ramos Tamayo. Instituto Tecnológico de Celaya. Tesis de Licenciatura. Titulado.
4. CRITERIOS DE REPERCUSIÓN ACADÉMICA
4.1 Haber publicado artículos en algunas de las principales revistas de la especialidad del más alto impacto internacional
4.1.1 Cuatro artículos en Plant Cell, la revista con mayor factor de impacto Mundial en el área de Plantas (Ver 2.1.a.1 y 2.1.a.5). Folder 4.2
4.1.2 Tres artículos en la Revista de la Académia de Ciencias de Los Estados Unidos. PNAS. (2.1.a.3 y 2.1.a.4) con alto factor de Impacto. Folder 4.2
4.1.3 Un artículos publicado en la Revista Cell en 2012, Cell es considerada como una de las “Top 3” junto a, y al nivel de, Nature y Science (2.1.a.8 y 2.1.a.9). En el caso del artículo reportado en 2.1.a.9, éste recibió 3 recomendaciones en Faculty of 1000 con calificaciones de 10 Excepcional Como Technical advance y New finding. Ver folder 4.2
4.2 Tener el promedio internacional de citas para la especialidad en artículos de investigación
4.2.1 Tener el promedio internacional de citas para la especialidad en artículos de investigación sin incluir autocitas.
De acuerdo con el ISI Web of Science Core Collection, sumo 729 citas hasta el 2016, contando sólo artículos de Investigación. El promedio de citas por artículo es de 74.
4.3 Tener citas en monografías y libros de reconocida importancia o citas múltiples en artículos internacionales de revisión en revistas de prestigio
Revisión: The role of nutrient availability in regulating root architecture. 2003, Current Opinion in Plant Biology, 6:280–287. Citado 518 veces de acuerdo con ISI Web of Science. Ver detalles en carpeta 4.2.
Total de citas sin autocitas: 1,237. Indice h: 11
4.4 Haber publicado artículos de investigación que hayan sido citados de manera extraordinaria, usando como guía el nivel sobresaliente de citas de la especialidad correspondiente al artículo.
De acuerdo con el nivel de citas de la especialidad cuyo máximo de citas sobresaliente es de 24.7 los Artículos 2.1.a.1, 2.1.a.2, 2.1.a.3, 2.1.a.4, 2.1.a.5, 2.1.a.8, 2.1.a.9 han sido citados de manera extraordinaria. Ver pruebas en folder 4.2.
4.5 Haber originado resultados de investigación que hayan sido tema de discusión por terceros en artículos de investigación, de revisión, libros de importancia en el área o memorias de congresos de prestigio. Se debe poder apreciar el tenor en el que se cita la contribución del autor.
4.5.1 Recomendaciones por Faculty of 1000 ver pruebas en folder
4.5.2 Recomendación en la revista Nature (Research Highlights)
4.5.3 Reconocimiento a mi trabajo en Revisión internacional al 50 aniversario de investigación con Arabidopsis. Unico Mexicano entre los trabajos más relevantes.
https://www.youtube.com/watch?v=ieGaiCFtKns&feature=youtu.be
https://www.newphytologist.org/news/view/106
4.11 Haber recibido una distinción académica notable.
4.11.1 Mención Honorífica para Tesis de Maestría E.N.C.B.-I.P.N.
4.11.2 Mención Honorífica para Tesis de Doctorado E.N.C.B.-I.P.N.
4.11.3 European Molecular Biology Organization, Postdoctoral Fellow.
4.11.4 Nivel 2 Sistema Nacional de Investigadores 2016
5.CRITERIOS ADICIONALES.
5.4 APOYO A ACTIVIDADES DE DIVULGACION DE LA CIENCIA COMO RECEPTOR DE VERANOS DE LA CIENCIA Y CLASES DE DIVULGACION
5.4.1 Platicas divulgación Semana Nacional de Ciencia y Tecnología para Bachillerato. Colegio de Bachilleres Estado de Hidalgo. 2000.
5.4.2 Evaluador en concursos de Cartéles Científicos, Universidad de la Salle Bajío, León Guanajuato 2013.
5.4.3 Recepción de 2 estudiantes en Verano Delfín 2014.
5.4.4 Académia de niños y Jóvenes en la Ciencia del Consejo de Ciencia y Tecnología de Guanajuato. Modalidad de Encuentros con niños de 5to y 6to año de primaria, Edición 2013 y 2014.
5.4.5 Ponente Seminario de Licenciatura en Microbiología. Universidad Aqutónoma de Querétaro. 8 Noviembre de 2013.
5.4.6 Asistencia y Ponencia en el Taller internacional de Conservación del Ajolote de Xochimilco. UAM-British Council. 24 al 28 de Marzo de 2014.
5.4.7 Ponencia 1er Simposio Conmemoración de Ingeniería Agroindustrial U.A.Q. 11 de Abril de 2014.
5.4.8 Presentación de Divulgación La Ciencia en el Kino. Universidad de Guanajuato. León Guanajuato 22 de Mayo de 2014.
5.4.9 Impartición de Conferencia sobre alimentos transgénicos Feria de Ciencias de la UDLSB. León Guanajuato. 7 de Mayo de 2014.
5.4.10 Impartición de Seminario Institucional invitado del Instituto de Fisiología de la UNAM. Septiembre 2014.
5.4.11 Invitación a impartir Conferencia Magistral en el Congreso Nacional de la Soicana de Genética. Xalapa, Veracruz30 de Septiembre a 3 de Octubre de 2014.
5.4.12 Conferencia en la Semana Nacional de la Ciencia, invitado por el CONCYTEG. Salamanca Guanajuato. Octubre 2014.
5.4.13 Conferencia VII Semana Tecnológica, ITESI Abasolo 2014. 22 a 24 de Octubre 2014.
5.4.14 Conferencia, a propósito de la exposición – Oseos-Cosmos, las formas del tiempo. Museo de la UDLSB. Septiembre 2015.
5.4.15 Top5 Post más visitado en y mejor evaluado en The Node 2015
http://thenode.biologists.com/top-node-posts-2015/highlights/
5.4.16 Entrevistas en radio, TV y artículos en Academia Mexicana de Ciencias, periódicos y otros medios hasta 2015:
https://www.youtube.com/watch?v=mgOrNHpZNcY
https://www.youtube.com/watch?v=9PbraOh1eZQ
http://www.jornada.unam.mx/2014/10/02/ciencias/a02n1cie
http://hojasnecias.com/nota.php?id=553
http://razon.com.mx/spip.php?article251197
http://quo.mx/noticias/2014/11/07/el-ajolote-dara-luz-en-lucha-contra-el-cancer
http://www.excelsior.com.mx/nacional/2014/11/06/991047
http://www.sopitas.com/453655-quieren-evitar-extincion-de-los-ajolotes-no-les-dan-dinero/
http://www.elinnovador.mx/noticia.php?w=1725
http://www.eluniversaldf.mx/home/salud-ajolotes-en-la-mira-para-curar-cancer-.html
http://www.elheraldodesaltillo.mx/v1/mexico/p2_articleid/103181
http://www.comoves.unam.mx/assets/revista/195/guiadelmaestro_195.pdf